Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms