Protein–RNA interactions for Protein: Q8R326

Pspc1, Paraspeckle component 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pspc1Q8R326 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pspc1Q8R326 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pspc1Q8R326 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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