Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc5Q8K4Z2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms