Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms