Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho1Q8K285 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms