Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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