Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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LgsnQ8CIX8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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