Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms