Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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