Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms