Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubqln3Q8C5U9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubqln3Q8C5U9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubqln3Q8C5U9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ubqln3Q8C5U9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ubqln3Q8C5U9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ubqln3Q8C5U9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ubqln3Q8C5U9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ubqln3Q8C5U9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubqln3Q8C5U9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms