Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms