Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Snx16Q8C080 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Snx16Q8C080 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Snx16Q8C080 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx16Q8C080 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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