Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Triml1Q8BVP1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms