Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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