Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms