Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms