Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gga3Q8BMI3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms