Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Me3Q8BMF3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Me3Q8BMF3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Me3Q8BMF3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Me3Q8BMF3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Me3Q8BMF3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Me3Q8BMF3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms