Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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