Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms