Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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