Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc172Q810N9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms