Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms