Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf7ipQ7TT18 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms