Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Clec18aQ7TSQ1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms