Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms