Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms