Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms