Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms