Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak2Q6P9N8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms