Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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