Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms