Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms