Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms