Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms