Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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