Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt39Q6IFX4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt39Q6IFX4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms