Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pkp4Q68FH0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkp4Q68FH0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkp4Q68FH0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkp4Q68FH0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms