Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2bQ64511 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms