Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms