Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52Q62393 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms