Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp1Q62209 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms