Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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