Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sin3bQ62141 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms