Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctr9Q62018 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms