Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vsx2Q61412 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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