Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift88Q61371 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ift88Q61371 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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