Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cln3Q61124 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cln3Q61124 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cln3Q61124 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms