Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms